
蝴蝶基因組大小進(jìn)化研究取得新進(jìn)展
(神秘的蝴蝶化研地球uux.cn報(bào)道)據(jù)中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所(進(jìn)化基因組學(xué)與基因起源學(xué)科組 作者:劉貴春,趙若蘋(píng)):蝴蝶因其豐富的基因究取進(jìn)展形態(tài)多樣性,自達(dá)爾文時(shí)代就作為研究物種適應(yīng)性進(jìn)化的小進(jìn)
臺(tái)州包夜外圍外圍上門(mén)外圍女(微信180-4582-8235)一二線熱門(mén)城市上門(mén)真實(shí)可靠快速安排30分鐘到達(dá)重要類(lèi)群之一,近幾年更被認(rèn)為是得新研究形態(tài)遺傳、進(jìn)化和發(fā)育的蝴蝶化研理想模型,已成為發(fā)育生物學(xué)、基因究取進(jìn)展進(jìn)化生物學(xué)、小進(jìn)種群遺傳學(xué)、得新保護(hù)生物學(xué)和生態(tài)學(xué)等研究領(lǐng)域的蝴蝶化研重要模式生物之一。
研究團(tuán)隊(duì)在2015年完成所有蝴蝶模式種金鳳蝶及其近緣種柑橘鳳蝶兩種鳳蝶基因組,基因究取進(jìn)展及以蝴蝶為例首次實(shí)現(xiàn)野生昆蟲(chóng)的小進(jìn)
臺(tái)州包夜外圍外圍上門(mén)外圍女(微信180-4582-8235)一二線熱門(mén)城市上門(mén)真實(shí)可靠快速安排30分鐘到達(dá)基因編輯(Li et al., 2015, Nature Communications)。在此基礎(chǔ)上,得新為了在蝴蝶系統(tǒng)發(fā)育的蝴蝶化研更大尺度下更好的探討蝴蝶形態(tài)等表型多樣性進(jìn)化的遺傳基礎(chǔ),于2017年啟動(dòng)了蝴蝶譜系基因組計(jì)劃?;蚓咳∵M(jìn)展作為蝴蝶譜系基因組計(jì)劃的小進(jìn)第一步和基礎(chǔ),該團(tuán)隊(duì)利用流式技術(shù)測(cè)定涵蓋中國(guó)分布所有科和幾乎所有亞科共67種蝴蝶的基因組C值,并利用二代測(cè)序技術(shù)對(duì)其線粒體基因組進(jìn)行組裝,其中1亞科23屬59種的線粒體基因組為首次報(bào)道。結(jié)合公共數(shù)據(jù)庫(kù)中的基因組大小和線粒體基因組數(shù)據(jù),構(gòu)建了6科29亞科145屬264種蝴蝶的蝴蝶系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),并在此系統(tǒng)發(fā)育框架上探討了6科24亞科71屬共106種蝴蝶基因組大小的進(jìn)化。研究結(jié)果表明,蝴蝶的基因組大小在0.203pg(199Mb)(蛺蝶科:Heliconius xanthocles)到1.287pg(1253Mb)(鳳蝶科:Parnassius orleans)之間,差異達(dá)6.4倍;科內(nèi)差異最大的是鳳蝶科(5.9倍:0.22-1.29pg),其次是蛺蝶科(4.8倍:0.2-0.95pg)、粉蝶科(4.4倍:0.22-0.97pg)、灰蝶科(2.6倍:0.39-1.02pg)、弄蝶科(2.2倍:0.3-0.66pg)和蜆蝶科(1.8倍:0.48-0.87pg)。研究結(jié)果還表明,蝴蝶的祖先基因組大小約為0.5pg,不同亞科或族的某些祖先基因組大小的增減事件導(dǎo)致了現(xiàn)生蝴蝶基因組大小的多樣性變異。這些研究結(jié)果不僅為蝴蝶基因組大小的進(jìn)化提供了新見(jiàn)解,而且也為未來(lái)的基因組測(cè)序計(jì)劃提供了重要的參考。該研究以Genome size variation in butterflies (Insecta, Lepidotera, Papilionoidea): A thorough phylogenetic comparison為題,于2020年01月7日在昆蟲(chóng)學(xué)頂尖期刊Systematic Entomology在線發(fā)表。網(wǎng)站鏈接https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/syen.12417。
該成果是在中國(guó)科學(xué)院昆明動(dòng)物研究所李學(xué)燕副研究員帶領(lǐng)的昆蟲(chóng)研究團(tuán)隊(duì)潛心專(zhuān)研下取得的,李學(xué)燕副研究員是該文的第一通訊作者,王文研究員是共同通訊作者,團(tuán)隊(duì)成員劉貴春實(shí)驗(yàn)師(暨西北工業(yè)大學(xué)在職博士生)、常洲實(shí)驗(yàn)師為該文的并列一作。本研究得到國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31621062)、中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專(zhuān)項(xiàng)(B類(lèi))(XDB13000000)、“西部青年學(xué)者”項(xiàng)目(A類(lèi))和遺傳資源與國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室(GREKF18-13)等的支持。